Taxonomía
Las poblaciones del norte de Nicaragua, se denominan cormoranes mexicanos u oliváceos, y muchos autores tratan a ésta como una especie separada (Phalacrocorax olivaceus). Aquellos autores que perciben una sola población la mantienen como una sola especie y las aves del norte las clasifican como la subespecie
Phalacrocorax brasilianus mexicanus y las aves del sur como pertenecientes a la subespecie
Phalacrocorax brasilianus brasilianus.
En 2014 se analizaron las relaciones filogenéticas de los comoranes, secuenciado más de 8000 pares de bases de ADN y como resultado se propuso que el clado Nannopterum, al que pertenece esta especie, debe ser tratado como un género diferente de Phalacrocorax, y que el nombre científico de la especie debe ser, por consiguiente, Nannopterum brasilianus.[6]