Historia ficticia
Médico de a bordo en la U.S.S. Enterprise desde 2266, McCoy, apodado cariñosamente "Bones" ("huesos"), es un doctor que se preocupa muy seriamente por la salud física y psíquica de su tripulación. Retirado después de la mítica misión de cinco años (Star Trek "Serie"), fue convocado de nuevo durante el incidente del V´ger (Star Trek: La película) y permaneció a bordo de la Enterprise en los años sucesivos. Con ocasión de la muerte de Spock (Star Trek II: La ira de Khan), McCoy fue elegido como depositario de su "Katra" hasta el momento del "fal-tor-pan", el antiguo ritual Vulcano que vuelve a unir mente y cuerpo (Star Trek III: En busca de Spock). Durante las negociaciones de paz con el Imperio Klingon, en el año 2293, se le acusó injustamente de la muerte del canciller Gorkon y fue encarcelado junto con Kirk en el planeta-prisión Rura Penthe (Star Trek VI: Aquel país desconocido). Esto permitió que ambos descubrieran la conspiración para acabar con las negociaciones de paz y pudieran desenmascararla. Tras retirarse del servicio activo con el grado de almirante, McCoy sigue en la actualidad a cargo de la inspección del equipamiento médico de la Flota Estelar.
McCoy casi siempre se queja de los nuevos aparatos médicos con los que ha de trabajar, alabando la "tradicional medicina de toda la vida"; sin embargo, cuando en la década de 1980 (Star Trek IV: Misión: salvar la Tierra) estuvo en contacto con la "medicina tradicional" reaccionó con cólera y disgusto ante la barbarie propia de la Inquisición.
En la película Star Trek de 2009, en una línea temporal alternativa, McCoy y Kirk comienzan su amistad cuando son jóvenes cadetes de la Flota Estelar y tras un diálogo en el que McCoy dice sobre su exmujer "me ha dejado en los huesos" ("left [him] nothing but [his] bones", en la versión original). Esta linea, improvisada por Urban explicaría como comienza a ser conocido como Huesos. McCoy ayuda tiempo después a Kirk a subir a la USS Enterprise.