Cada color tiene un significado: el verde significa prosperidad, el blanco a la paz y el rojo a los héroes caídos por la libertad de su pueblo, mientras que la shahada representa al Islam. La estrella negra representa el deseo de unificar a los cinco pueblos somalíes: Somalilandia, Somalia, la provincia de Ogaden en Etiopía, Yibuti y parte del norte de Kenia.
Previamente, otra bandera fue usada hasta 1996, consistente en un campo blanco con un disco central de color verde alrededor del cual se escribía la shahada.